Oddzielne trackery celowo mogą pracować inaczej, jeśli obsługują połacie o różnej orientacji, nachyleniu, liczbie modułów lub zacienieniu. Problem pojawia się, gdy dwa porównywalne pola w tych samych warunkach dają trwale różne moce. Przyczyną może być zabrudzenie, cień, niedopasowany łańcuch, uszkodzenie modułu, złącza lub diody, ograniczenie prądowe wejścia albo błędna konfiguracja. Porównanie samej energii dobowej bez uwzględnienia geometrii słońca może prowadzić do fałszywej diagnozy.
Należy porównać osobno napięcie, prąd i moc obu trackerów w kilku godzinach oraz odnieść je do projektu. Sprawdza się liczbę i typ modułów, orientację, zacienienie, zabrudzenie oraz maksymalne parametry wejść. Jeśli konstrukcja pozwala, instalator może wykonać kontrolowaną zamianę wejść po bezpiecznym wyłączeniu; przeniesienie objawu wskazuje na pole PV, a pozostanie na wejściu na falownik lub ustawienia. Pomiary krzywych, termowizja i kontrola złączy lokalizują różnicę bez zgadywania.
Nie należy wyrównywać wykresów przez łączenie różnych połaci na jednym trackerze ani przepinać złączy podczas pracy. Może to pogorszyć uzysk i przekroczyć napięcie lub prąd wejścia. Czyszczenie ma sens dopiero po porównaniu warunków i wykonuje się je metodą bezpieczną dla powłoki modułów. Uszkodzony łańcuch pozostawia się odłączony zgodnie z instrukcją do naprawy. Po zmianie konfiguracji trzeba ponownie obliczyć napięcie w najniższej temperaturze i prąd maksymalny oraz zaktualizować schemat instalacji.